監視フォルダの中のデータを開いている場合には、変換対象から除外されるようになっておりますが、一旦変換を開始したファイルを編集、あるいは削除されますと正しく動作できませんので、監視フォルダの中のデータの編集操作(開く操作も含む)は避けてください。